Die Vorgaben der EU-Bestimmungen über die ökologische Produktion und die Kennzeichnung von ökologischen Erzeugnissen sind Grundlage für die IG Bio-Initiative. Ziel ist ein Standard, der sowohl die Interessen der Produzenten von biologisch erzeugten Produkten zur Differenzierung gegenüber Mitbewerbern abdeckt als auch die Wünsche der Verbraucher hinsichtlich des Umweltschutzes und der Tiergesundheit berücksichtigt.

Zur Umsetzung und Einhaltung dieser Vorgaben hat die Bio-Initiative einheitliche Kriterien für die jeweiligen Kontrollstellen erstellt. Diese sind Voraussetzung für die Zulassung und regeln auch die Zuständigkeit.